Avec Qgis 3.4, la gestion des métadonnées se trouve dans les propriétés des différentes couches :

On peut alors compléter les différentes informations nécessaires au bon suivi des différents jeux de données.
Il est possible d'exporter les metadonnées (au format .QMD) : clic sur Métadonnées (en bas à gauche sur l'image) / Sauvegarder les métadonnées